MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1 chromosome

Total Repeats: 2015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011126	T	8	8	56	63	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011126	TA	3	6	87	92	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011126	A	7	7	127	133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011126	T	6	6	157	162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011126	TCAAA	2	10	178	187	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_011126	A	7	7	185	191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011126	TTG	2	6	230	235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011126	TA	3	6	2759	2764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011126	T	6	6	2766	2771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011126	GTT	2	6	2785	2790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011126	TAAAAT	2	12	2798	2809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011126	CCT	2	6	8685	8690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_011126	ATTA	2	8	10630	10637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011126	AT	3	6	10647	10652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011126	TAT	2	6	10669	10674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011126	ATTCA	2	10	10675	10684	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011126	TAT	2	6	10688	10693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011126	ACC	2	6	10826	10831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_011126	TAT	2	6	10846	10851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011126	AAT	2	6	10852	10857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011126	T	7	7	10914	10920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011126	GTA	2	6	10931	10936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011126	ATGA	2	8	11051	11058	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011126	CCT	2	6	11572	11577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_011126	T	6	6	11621	11626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011126	TTTG	2	8	11630	11637	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011126	T	6	6	11686	11691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011126	ATT	2	6	11697	11702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011126	AT	3	6	11729	11734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011126	GTTT	2	8	11767	11774	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011126	A	6	6	11792	11797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011126	TTTA	2	8	16377	16384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011126	ATTT	2	8	16411	16418	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011126	TGA	2	6	17471	17476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011126	AT	3	6	18818	18823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011126	TA	3	6	20997	21002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011126	TA	3	6	21027	21032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011126	TACTC	2	10	21119	21128	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_011126	GTCC	2	8	21136	21143	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011126	GATT	2	8	21936	21943	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011126	AAT	2	6	21972	21977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011126	TTA	2	6	23556	23561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011126	TAT	2	6	29335	29340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011126	GTTC	2	8	30001	30008	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011126	GTGCCT	2	12	30149	30160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011126	ATCT	2	8	30170	30177	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011126	A	7	7	32994	33000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011126	CCT	2	6	33519	33524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_011126	T	7	7	33549	33555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011126	TTA	2	6	33561	33566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011126	CCT	2	6	34994	34999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_011126	ATA	2	6	35008	35013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011126	T	6	6	35018	35023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011126	TTG	2	6	35075	35080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011126	TA	4	8	35090	35097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011126	CCT	2	6	37176	37181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_011126	ATA	2	6	37194	37199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011126	CCT	2	6	39109	39114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_011126	GAT	2	6	39118	39123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011126	AAAT	2	8	39139	39146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011126	ATT	2	6	39159	39164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011126	TAT	2	6	39201	39206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011126	ATA	2	6	39263	39268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011126	CCT	2	6	49443	49448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_011126	AATA	2	8	49453	49460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011126	ATTA	2	8	49464	49471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011126	ATT	2	6	49553	49558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011126	TAT	2	6	49606	49611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011126	CTG	2	6	49633	49638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011126	A	9	9	49649	49657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011126	TA	3	6	49681	49686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011126	TATAAA	2	12	53769	53780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011126	TAA	2	6	53798	53803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011126	CGA	2	6	54549	54554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011126	CGCCT	2	10	54593	54602	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
76	NC_011126	TTTTA	2	10	56592	56601	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011126	TTTAT	2	10	60181	60190	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011126	AT	4	8	60231	60238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011126	TAA	2	6	60260	60265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011126	AT	3	6	60272	60277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011126	GAT	2	6	60322	60327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011126	AAAC	2	8	60357	60364	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_011126	CT	4	8	60381	60388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_011126	GCT	2	6	60390	60395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011126	AGC	2	6	60404	60409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011126	TGGT	2	8	60466	60473	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011126	TAA	2	6	60633	60638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011126	GACG	2	8	60678	60685	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011126	CGC	2	6	60699	60704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_011126	CCA	2	6	60707	60712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_011126	TAA	3	9	60713	60721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011126	ACA	2	6	60722	60727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011126	ATA	2	6	60767	60772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011126	ATTA	2	8	60781	60788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011126	TAAAA	2	10	61325	61334	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011126	ATAAA	2	10	65512	65521	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011126	TA	3	6	65522	65527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011126	CTG	2	6	67603	67608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011126	AGT	2	6	67661	67666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011126	CCT	2	6	67950	67955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_011126	CCT	2	6	68589	68594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_011126	A	7	7	68607	68613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011126	TAT	2	6	72223	72228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011126	ATCT	2	8	72293	72300	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011126	T	8	8	72300	72307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011126	TGAG	2	8	72322	72329	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011126	GTGG	2	8	72354	72361	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011126	AGTT	2	8	72380	72387	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011126	TGT	2	6	72401	72406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011126	TA	3	6	74498	74503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011126	AT	3	6	77295	77300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011126	A	6	6	77325	77330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011126	TATAA	2	10	77332	77341	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011126	AGG	2	6	77383	77388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011126	AGG	2	6	78202	78207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011126	TTA	2	6	79258	79263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011126	ATTT	2	8	79290	79297	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011126	TATT	2	8	79363	79370	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011126	CTCC	3	12	79419	79430	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
120	NC_011126	T	6	6	79442	79447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011126	TA	3	6	82147	82152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011126	CTT	2	6	88914	88919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011126	T	6	6	88918	88923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011126	CTA	2	6	88924	88929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011126	A	6	6	88941	88946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011126	GTAT	2	8	88970	88977	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011126	TA	5	10	89007	89016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011126	T	6	6	94798	94803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011126	TTA	2	6	94841	94846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011126	ATG	2	6	94851	94856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011126	AGG	2	6	94892	94897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011126	T	6	6	95619	95624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011126	TAT	2	6	97606	97611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011126	TA	3	6	97660	97665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011126	GGT	2	6	97683	97688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011126	GGT	2	6	100504	100509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011126	G	6	6	100523	100528	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011126	T	6	6	100569	100574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011126	T	8	8	100576	100583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011126	ATA	2	6	100589	100594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011126	TTAAA	2	10	101152	101161	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011126	AT	3	6	105918	105923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011126	GAT	2	6	105943	105948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011126	TA	3	6	106053	106058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011126	GAT	2	6	106086	106091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011126	AGC	2	6	107721	107726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_011126	TCG	2	6	107735	107740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_011126	TTGG	2	8	111018	111025	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011126	TTC	2	6	111951	111956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_011126	TTA	2	6	111969	111974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011126	GTT	2	6	111997	112002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011126	TA	4	8	112148	112155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_011126	AT	3	6	112179	112184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011126	TATG	2	8	112196	112203	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_011126	TAT	2	6	112223	112228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_011126	T	8	8	113545	113552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_011126	TTA	2	6	113558	113563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_011126	TAT	2	6	113564	113569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_011126	AGG	2	6	113572	113577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_011126	CCT	2	6	119138	119143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
169	NC_011126	T	6	6	119167	119172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_011126	TAT	2	6	119203	119208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_011126	TA	3	6	124421	124426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_011126	CAC	2	6	134955	134960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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187	NC_011126	A	6	6	136569	136574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_011126	TAG	2	6	221243	221248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_011126	TTTC	2	8	221340	221347	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
284	NC_011126	TTC	2	6	221362	221367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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286	NC_011126	ACT	2	6	221435	221440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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289	NC_011126	T	8	8	222182	222189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_011126	GAA	2	6	222190	222195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_011126	TATAA	2	10	222200	222209	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_011126	AGTA	2	8	222215	222222	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
293	NC_011126	GA	3	6	222224	222229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
294	NC_011126	CT	3	6	222298	222303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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299	NC_011126	GTTTT	2	10	222397	222406	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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327	NC_011126	TGT	2	6	265437	265442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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414	NC_011126	AAT	2	6	360783	360788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_011126	AAATA	2	10	390761	390770	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_011126	A	6	6	390786	390791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
423	NC_011126	AAG	2	6	391907	391912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
424	NC_011126	TA	3	6	391929	391934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
425	NC_011126	TCC	2	6	392392	392397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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427	NC_011126	TGT	2	6	393513	393518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
428	NC_011126	ATTATA	2	12	393748	393759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
429	NC_011126	TA	4	8	393756	393763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_011126	CCT	2	6	397758	397763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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462	NC_011126	AT	3	6	406494	406499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_011126	TAA	2	6	406507	406512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_011126	TTAAA	2	10	406526	406535	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_011126	GGTT	2	8	406544	406551	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_011126	AG	3	6	413262	413267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
483	NC_011126	AAT	2	6	413279	413284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_011126	CAT	2	6	413357	413362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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486	NC_011126	ATCT	2	8	413411	413418	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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489	NC_011126	TAT	3	9	413508	413516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_011126	TGTT	2	8	413530	413537	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
491	NC_011126	A	6	6	413538	413543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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